Licencia: CC BY-SA 4.0 (Junio 2022)
El proyecto IMPaCT-Data presenta públicamente el vídeo en el que se demuestra la primera iteración funcional del desarrollo de la nube biomédica federada de IMPaCT-Data. Este material fue mostrado por primera vez a los socios del proyecto durante la tercera asamblea general que tuvo lugar en junio de 2022.
En esta primera iteración, la nube de computación para datos biomédicos cumple con las características de disponer de un proceso de acceso de usuarios federado y ejecutar trabajos mediante el uso de recursos computacionales compartidos.
En el vídeo mostramos la conexión de un usuario al nodo central de la infraestructura mediante las credenciales de uno de los nodos que forman parte de la infraestructura federada, siendo posible así su autenticación y acceso a la plataforma Galaxy. Acto seguido, el usuario utiliza una herramienta con los datos que tiene en su nube personal. El vídeo muestra como la ejecución de esa herramienta se realiza de forma distribuida en varios de los nodos de computación de la nube federada de IMPaCT-Data gracias a la red Pulsar. Finalmente, el usuario visualiza y tiene a su disposición los resultados en formato HTML y en crudo, así como metadatos, parámetros de entrada y salida de cada una de las ejecuciones realizadas.
Próximas iteraciones de la nube federada permitirán el acceso controlado a datos biomédicos protegidos y a datos integrados provenientes de estudios genómicos, historia clínica electrónica e imagen médica.
El desarrollo de la nube federada de IMPaCT-Data recae en el paquete de trabajo 2, dedicado a la infraestructura, que está coordinado por el Barcelona Supercomputing Center - Centro Nacional de Supercomputación (BSC-CNS, Barcelona), con la participación del Centro Nacional de Investigaciones Cardiovasculares Carlos III (CSIC, Madrid), el Instituto Murciano de Investigación Biosanitaria (IMIB, Murcia) y Navarra de Servicios y Tecnologías (NASERTIC, Navarra) como parte de Navarrabiomed (Centro de Investigación Biomédica – Fundación Miguel Servet).