El plan de trabajo de IMPaCT-Data está detallado en el plan estratégico de IMPaCT, disponible en
la web del Instituto Carlos III (ISCIII).
El trabajo está distribuido en 6 paquetes de trabajo (WP por sus siglas en inglés - Work package). Los detalles de los entregables de
los paquetes de trabajo están accesibles en las
entregables del proyecto.
Coordinación del proyecto.
Tareas:
- Coordinación con los otros dos programas de IMPaCT.
- Coordinación con los servicios de salud de las CC.AA.
- Coordinación y gestión interna del programa.
- Comunicación y difusión de las actividades del programa.
- Coordinar la participación de las entidades asociadas en las actividades del programa.
- Formación específica.
Infraestructura computación en la nube para la gestión e integración de datos.
Tareas:
- Implementación inicial y evaluación de un sistema de computación para datos biomédicos asociados a IMPaCT.
- Adopción e implantación de protocolos para el uso de contenedores software y flujos de trabajo siguiendo las recomendaciones de ELIXIR, EOSC-Life y GA4GH.
Implementación de sistemas para el análisis, integración e interpretación de datos genómicos.
Tareas:
- Implementación de sistemas de almacenamiento de información genómica primaria mediante instancias Federadas de EGA.
- Adaptación, instalación y uso de software de código abierto para el análisis e integración de distintas fuentes de datos.
Implementación de sistemas para el análisis, integración e interpretación de datos clínicos incluyendo imágenes.
Tareas:
- Adaptación, instalación y uso de software de código abierto para la extracción de variables a partir del HCE.
- Adaptación, instalación y uso de herramientas de software de código abierto para el seguimiento y validación de los procesos de extracción y tratamiento de los datos de imagen médica.
Diseño e implementación inicial de los sistemas de interconexión entre datos genómicos, imagen médica y médicos.
Tareas:
- Integración de datos genómicos y radiómicos con datos médicos estructurados para su uso secundario.
- Implantación de mecanismos para la identificación automática de información genómica relevante, o contenido de las imágenes
médicas que den respuestas anonimizadas al estilo beacon.
Casos de uso para la aplicación de la metodología y evaluación de su calidad.
Tareas:
- Desarrollo de los casos de uso alineados con IMPaCT.
- Evaluación de aspectos de seguridad en el manejo de datos sensibles, como procesos de pseudonimización, accesibilidad, trazabilidad y privacidad de los datos.
